李成桂建立朝鮮王朝之后，覺得高麗的王京（今朝鮮開城）王氣已經十分薄弱，于是由權仲和、鄭道傳等人擇定佳地，在1392年開始在漢江之北的漢陽營建新都。這里山環水抱，北有北漢山、北岳山，東有洛山和龍馬山，西有仁王山，南有南山和漢江以南的冠岳山，漢江自東向西環抱城南，呈龍砂水穴“山水襟帶”的上好風水格局。城內大興土木，營建宮殿、宗廟、社稷、兩班衙署、道路。1394年，李成桂將都城從開京遷移到了漢陽(Hanyang，??)，并正式命名為漢城(Hanseong，??)。在朝鮮王朝時期，漢城又稱“都城”、“京”。

1592年，日本入侵朝鮮。壬辰衛國戰爭爆發。5月2日，留都大將金命元、副元帥申恪率兵千余，屯濟川亭，望見日軍聲勢浩大，不敢拒，悉沉軍器于江中，以匹馬走逃，諸軍皆潰。加藤清正率領日本軍隊度過漢江，攻占漢城。日軍入城前后，漢城遭到很大的破壞。在國王出逃前夕，城中宮殿、社稷、衙署、城門以及宮內珍寶、歷代典籍、文物禮器全部被朝鮮方面焚毀，而宗廟獨存。日將平秀家長盛入城后曾處其中。后長盛焚宗廟，移寓南別宮，指揮諸路之倭向北追擊。1593年4月，日本軍隊撤兵南下，臨行前將城中人民屠戮殆盡。是年11月朝鮮宣祖國王返京時，宮闕俱燼，荊棘滿城，百官依墻壁以坐，不得不以月山大君舊第為行宮，桂林君家為大內，沈義謙家為東宮，故領相沈連源家為宗廟，以附近大小民家為闕內各司（稱時御所）。光海君時期將宗廟和宮殿擇要修復。